Jak vypočítat izoelektrický bod
Izoelektrický bod (pI) je pH (hodnota kyseliny v roztoku), ve které má molekula v roztoku nulový čistý náboj. Tato hodnota je důležitá zejména v biochemii jako základní charakteristiky proteinů. Proteiny mají čistý pozitivní náboj pH roztoku pod izoelektrickým bodem; jsou negativně nabité, pokud je pH vyšší. Izoelektrický bod je funkcí složení aminokyselin proteinu. Proto je pro výpočet pl je nezbytná aminokyselinová sekvence proteinů.
Bez proteinové sekvence
Rozhodněte, jak získat proteinovou sekvenci. Pokud je sekvence již k dispozici, přejděte přímo do části 2. Jinak ji získáte z databáze Univerzální zdroje proteinů.
Zadejte název proteinu jako klíčové slovo do pole dotazu a stiskněte "Hledat".
Přejděte dolů na výsledky vyhledávání a vyhledejte odpovídající položku. Zadejte přístupové číslo databáze.
Přejděte na Nástroj pro výpočet serveru ExPASy.
Do pole zadejte přístupové číslo databáze v kroku 4 a stiskněte tlačítko "Klepnutím sem vypočtete pI / Mw".
Klikněte na tlačítko Odeslat na další obrazovce.
Přečtěte si hodnotu izoelektrického bodu (pI).
Se sekvencí proteinů
Pokud je sekvence již dostupná, přejděte do nástroje pro výpočet serveru ExPASy.
Zadejte sekvenci ručně do pole nebo jej zkopírujte a vložte ji ze souboru. Stiskněte tlačítko "Kliknutím sem vypočtete pI / Mw".
Přečtěte si hodnotu izoelektrického bodu (pI).